Геймплей "Crysis 2" не тронули, а немного доработали, так что он будет похож на геймплей предшественника. Как и в оригинале,
геймплей Crysis 2 называется "Veni vidi vici" - "Пришел, увидел, победил", но при этом, он не только сохранит свободный стиль песочницы, открытые и свободные уровни, но и улучшит их. Игроки будут иметь больше свободы в разных боевых ситуациях. На уровнях будет множество разрушаемых и взаимодействующих с игроком объектов.

Большой плюс - наличие в игре так называемого "Вертикального Геймплея". Вертикальный геймплей состоит в том, что игрок может передвигаться не только по плоскости, но и в направлении "Вверх-Вниз". В соответствии с таким нововведением был модифицирован игровой ИИ врагов. Игровые локации имеют несколько вертикальных уровней, по которым игрок будет перемещаться. То есть, можно передвигаться по дорогам, по крышам автомобилей, по разным этажам и крышам зданий. Можно будет даже перепрыгивать с одного здания на другое.

В "Crysis 2" имеется система укрытий в режиме первого лица. Игрок может прижиматься к укрытиям и высовываться из них для стрельбы. Впервые видеодемонстрация системы укрытий была показана на выставке "Game Developers Conference 2010".

"Nanosuit 2" - усовершенственый прототип "Nanosuit"
Режимы: "сила" и "скорость", которые присутствовали в оригинале, объединены в новый - "мощь".
Режим "проникновение" - стал пассивным и предоставляет расширенные по сравнению с оригиналом возможности стелса, включая опцию невидимости, которую нужно активировать дополнительно.
Режим: "броня" полностью переработан.
Режим: "тактический" - представляет собой полностью новый режим, не имеющий аналога ранее. В этом режиме игрок может собирать информацию на уровне, включая позиции и статусы врагов, нейтралов и союзников, а также целей и предметов. Также в этом режиме можно ставить метки на местности или предметах. Данный режим отображает информацию об увиденных на расстоянии мёртвых людях и пришельцах, об оружии, а еще дает игроку подсказки, как действовать в той или иной ситуации.

HUD полностью изменён. Причём для каждого режима в "Nanosuit 2" имеется свой особенный HUD.
"Nanosuit 2" можно совершенствовать, усиливая его возможности и добавляя новые. В настоящий момент известно о таких апгрейдах, как режим рентгеновского зрения, способность рикошетить попадаемые в нанокостюм пули и трассирующие пули.
Ещё одной новой особенностью "Nanosuit 2" - является переключения режимов. На короткое время после того, как игрок переключил нанокостюм из одного режима во второй, "Nanosuit 2" запоминает и имеет свойства обоих режимов.

Игра переместит нас, в Будущее, в 2023 год, в культовый, в современый город "Нью-Йорк". Но, нам не удастся полюбоватся, замечательным и красивым городом лицом Туриста.
Так как, крупнейшие города мира разрушены и опустошены, в том числе и "Нью-Йорк". Мир потрясла серия экологических катастроф, и человечество находится на грани вымирания. Святая из святых - "Земля", подверглась нападению инопланетян, решивших стереть людей с ее поверхности. "Нью-Йорк" наводнили инопланетные захватчики, и волна оживших кошмаров постепенно захлестывает город и его жителей. Городские коммуникационные системы разрушены, здания лежат в руинах. Такой вот "Нью-Йорк" мы с вами и увидем.

Военные "США" и "НАТО" - не могут справиться с захватчиками,
Военные других Стран Мира - сами пытаются выжить.
Воздушное пространство контролируется космическими кораблями, а в города для контроля запущены специальные зонды. Короче - инопланетные душонки совсем оборзели. Но отчаиватся рано, так что надерем их тощие... ну, вы поняли меня. А чтобы выжить в этом хаосе, нам понадобятся технологии, которые запрещены законом Конвенции.

Мы типа, суперсолдат, вооруженный и экипированный по последнему слову технологий будущего в "Nanosuit 2", предпримем отчаянную попытку спасти человечество на улицах "Нью-Йорка".

Пришельцы захватили большую часть территории Земли и ведут на ней постоянные сражения с людьми. Крупнейшие города мира разрушены и опустошены. Воздушное пространство контролируется космическими кораблями, а в города для контроля запущены специальные зонды. Действие игры будет разворачиваться в разрушенном и опустошенном Нью-Йорке. Но, несмотря на опустошение, в городе будут обитать военные и некоторые выжившие. Ещё одной особенностью сюжета является введение третьей силы, которая будет враждебна как к игроку и его союзникам, так и к инопланетянам. Причём это будет не северокорейская армия. На данном этапе разработки игры эта фракция называется «Crynet Ops», однако в финальном релизе это название будет изменено.

Протагонист Crysis 2 в настоящее время точно не известен. Им может быть Джейк Данн с позывным именем Номад, протагонист первой части, или же майор Лоренс Бернс с позывным именем Пророк, один из главных персонажей первой части.

Разработчики заявляют, что Crysis 2 будет иметь более жесткую и убедительную сюжетную историю по сравнению с оригиналом. При этом несколько изменится сама подача сюжета. Его фрагменты игрок должен будет раскрывать самостоятельно путём исследования мира, разговора с NPC, прослушивания личных записей и т. д. Авторы заявляют, что серия Crysis станет полностью самодостаточной и очерченной вымышленной вселенной, со своей фоновой историей и множеством мелких деталей.

Нэйтан Камарилло, сотрудник Crytek, заявил, что разработчики не хотят, чтобы игрокам для понимания сюжета Crysis 2 необходимо было ознакомиться с Crysis. Вместе с тем Crysis 2 ответил на много сюжетных вопросов, нераскрытых в оригинале.